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学術解析
単細胞トランスクリプトミクス解析
Project Question
研究室は、原稿準備中の腫瘍微小環境scRNA-seqデータから免疫細胞集団を特徴付ける必要がありました。
Analysis Approach
品質管理、正規化、クラスタリング、および細胞タイプ注釈を適用。マーカー遺伝子を同定し、クラスター間の発現解析を実行し、出版対応UMAPとバイオリンプロットを生成。
Input Data
- scRNA-seqカウント行列
- サンプルメタデータ
- 参照マーカーリスト
Deliverables
- UMAPクラスタリング図
- 細胞タイプ比率プロット
- マーカー遺伝子ヒートマップ
- 発現解析テーブル
- 原稿用方法要約
レイアウトデモ用にモックデータから生成された代表的なUMAPクラスタリングプロット。
この出力は解析アプローチと可視化スタイルを表します。実際のプロジェクト結果は入力データ品質、サンプルサイズ、および検証戦略に依存します。