프로테오믹스 분석
Proteomics
DIA(데이터 비의존 취득) 및 DDA(데이터 의존 취득) 질량 분석 데이터에 대해 단백질 동정·정량부터 차등 발현 분석, 번역 후 수정(PTM) 분석까지의 완전한 워크플로를 제공합니다. 바이오마커 발견·약물 표적 연구를 지원합니다.
적용 시나리오
- 질병 바이오마커 발견
- 약물 작용 메커니즘 연구
- 신호 경로 교란 분석
- 번역 후 수정 조절 연구
데이터 입력
- DIA/DDA 질량 분석 원시 데이터(raw / mzML)
- 실험 설계 그룹 정보
- FASTA 데이터베이스(대상 종)
출력
- 단백질 동정·정량 매트릭스
- 차등 발현 단백질 화산 플롯·히트맵
- GO/KEGG 기능 풍부
- 단백질-단백질 상호작용(PPI) 네트워크
- PTM 부위 동정·차등 분석
분석 워크플로
01
Database Search
MaxQuant / DIA-NN / Proteome Discoverer 데이터베이스 검색
02
Quantification
LFQ / TMT / DIA-NN 정량
03
QC
PCA, 상관 히트맵, 결측값 평가
04
DE Analysis
limma / Perseus / DEP 차등 분석
05
Functional
GO/KEGG, GSEA, PPI(STRING/Cytoscape)
06
PTM
인산화·아세틸화·유비퀴틴화 부위 동정·차등 분석