蛋白质组学分析
Proteomics
针对 DIA（数据非依赖采集）和 DDA（数据依赖采集）质谱数据，提供从蛋白鉴定、定量到差异表达分析和翻译后修饰（PTM）分析的完整流程，支持生物标志物发现和药物靶点研究。
适用场景
- 疾病生物标志物发现
- 药物作用机制研究
- 信号通路扰动分析
- 翻译后修饰调控研究
数据输入
- DIA/DDA 质谱原始数据（raw / mzML）
- 实验设计分组信息
- FASTA 数据库（目标物种）
交付输出
- 蛋白鉴定与定量矩阵
- 差异表达蛋白火山图与热图
- GO/KEGG 功能富集
- 蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络
- PTM 位点鉴定与差异分析
分析流程
01
Database Search
MaxQuant / DIA-NN / Proteome Discoverer 搜库
02
Quantification
LFQ / TMT / DIA-NN 定量
03
QC
PCA、相关性热图、缺失值评估
04
DE Analysis
limma / Perseus / DEP 差异分析
05
Functional
GO/KEGG、GSEA、PPI（STRING/Cytoscape）
06
PTM
磷酸化 / 乙酰化 / 泛素化位点鉴定与差异分析